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中央研究院历史语言研究所现存的明清档案，核心在于清代“内阁大库”所藏档案，这批档案在清末大库整修时被移出，历经辗转，最终于民国时期为史语所购入并保存。史语所目前保存的明清档案数量规模相当可观。根据其“明清档案工作室”公开介绍，史语所藏原属清朝内阁大库的各类文书约三十多万件，包括诏令、题奏、移会、敕谕、簿册、实录稿本、内阁各厅房处与修书各馆的档案、试题、试卷等种类繁多。在明代层面，则存文书数以四千件计。这些档案的来源与流转有一段颇为曲折的史事：清廷在宣统年间整修内阁大库，部份档案移出。清亡后，这批档案曾被多次转手，甚至一度被卖入纸厂作为废料处理。后来被书商与收藏者收买、散失部分。史语所首任所长傅斯年等人在 1929 年从藏书人李盛铎手中购得这批档案的部分残存，并开始委以整理与保存。在近现代以来的整理、数字化及出版方面，史语所成立了“明清档案工作室”，承担对这批档案的保护、编目、影像化、提要编写与出版等工作。
《明清档案》一书即是将史语所藏内阁大库明清档案按缩影方式影印、辑录出版的成果。其全称为《中央研究院历史语言研究所现存清代内阁大库原藏明清档案》，也有简称。该套《明清档案》全套 324 册，是按照时间顺序对资料进行安排，每册按年分期、主题归类，便于对明清内阁档案进行系统阅读与研究。
